TAP SWI/SNF_BAF60b in Panicum virgatum

Full lineage¹: cellular organisms; Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Streptophytina; Embryophyta; Tracheophyta; Euphyllophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; Mesangiospermae; Liliopsida; Petrosaviidae; commelinids; Poales; Poaceae; PACMAD clade; Panicoideae; Panicodae; Paniceae; Panicinae; Panicum; Panicum sect. Hiantes

Protein source: Phytozome (proteins from primary transcripts)


The colour code corresponds to the rules for the domains:

should be contained
should not be contained

Domain rules

SWIB

(Domain names are clickable)



List of proteins (32)

hide all | show all
namename additionClick button to show/hide sequence: Download sequence?
Pavir.Aa01158.1.ppacid=30253093 transcript=Pavir.Aa01158.1 locus=Pavir.Aa01158 ID=Pavir.Aa01158.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Aa03146.1.ppacid=30252245 transcript=Pavir.Aa03146.1 locus=Pavir.Aa03146 ID=Pavir.Aa03146.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Aa03176.1.ppacid=30251932 transcript=Pavir.Aa03176.1 locus=Pavir.Aa03176 ID=Pavir.Aa03176.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ab00144.1.ppacid=30232057 transcript=Pavir.Ab00144.1 locus=Pavir.Ab00144 ID=Pavir.Ab00144.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ab02495.1.ppacid=30232163 transcript=Pavir.Ab02495.1 locus=Pavir.Ab02495 ID=Pavir.Ab02495.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ca02391.1.ppacid=30204005 transcript=Pavir.Ca02391.1 locus=Pavir.Ca02391 ID=Pavir.Ca02391.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Da01246.1.ppacid=30194651 transcript=Pavir.Da01246.1 locus=Pavir.Da01246 ID=Pavir.Da01246.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ea02748.1.ppacid=30231603 transcript=Pavir.Ea02748.1 locus=Pavir.Ea02748 ID=Pavir.Ea02748.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ea03619.1.ppacid=30229175 transcript=Pavir.Ea03619.1 locus=Pavir.Ea03619 ID=Pavir.Ea03619.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Eb02338.1.ppacid=30312691 transcript=Pavir.Eb02338.1 locus=Pavir.Eb02338 ID=Pavir.Eb02338.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Eb03103.1.ppacid=30310297 transcript=Pavir.Eb03103.1 locus=Pavir.Eb03103 ID=Pavir.Eb03103.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ia00350.1.ppacid=30212445 transcript=Pavir.Ia00350.1 locus=Pavir.Ia00350 ID=Pavir.Ia00350.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ia00374.1.ppacid=30210155 transcript=Pavir.Ia00374.1 locus=Pavir.Ia00374 ID=Pavir.Ia00374.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ia01429.1.ppacid=30210242 transcript=Pavir.Ia01429.1 locus=Pavir.Ia01429 ID=Pavir.Ia01429.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ia02309.1.ppacid=30214468 transcript=Pavir.Ia02309.1 locus=Pavir.Ia02309 ID=Pavir.Ia02309.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ib00107.1.ppacid=30239634 transcript=Pavir.Ib00107.1 locus=Pavir.Ib00107 ID=Pavir.Ib00107.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ib03741.1.ppacid=30243027 transcript=Pavir.Ib03741.1 locus=Pavir.Ib03741 ID=Pavir.Ib03741.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J00207.1.ppacid=30282246 transcript=Pavir.J00207.1 locus=Pavir.J00207 ID=Pavir.J00207.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J00623.1.ppacid=30247482 transcript=Pavir.J00623.1 locus=Pavir.J00623 ID=Pavir.J00623.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J01716.1.ppacid=30231867 transcript=Pavir.J01716.1 locus=Pavir.J01716 ID=Pavir.J01716.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J01815.1.ppacid=30191050 transcript=Pavir.J01815.1 locus=Pavir.J01815 ID=Pavir.J01815.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J05472.1.ppacid=30208389 transcript=Pavir.J05472.1 locus=Pavir.J05472 ID=Pavir.J05472.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J05594.1.ppacid=30270446 transcript=Pavir.J05594.1 locus=Pavir.J05594 ID=Pavir.J05594.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J10040.1.ppacid=30286108 transcript=Pavir.J10040.1 locus=Pavir.J10040 ID=Pavir.J10040.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J11471.1.ppacid=30256983 transcript=Pavir.J11471.1 locus=Pavir.J11471 ID=Pavir.J11471.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J18174.1.ppacid=30243716 transcript=Pavir.J18174.1 locus=Pavir.J18174 ID=Pavir.J18174.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J20132.1.ppacid=30275320 transcript=Pavir.J20132.1 locus=Pavir.J20132 ID=Pavir.J20132.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J20794.1.ppacid=30271847 transcript=Pavir.J20794.1 locus=Pavir.J20794 ID=Pavir.J20794.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J25917.1.ppacid=30208767 transcript=Pavir.J25917.1 locus=Pavir.J25917 ID=Pavir.J25917.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J26772.1.ppacid=30272624 transcript=Pavir.J26772.1 locus=Pavir.J26772 ID=Pavir.J26772.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J27732.1.ppacid=30197499 transcript=Pavir.J27732.1 locus=Pavir.J27732 ID=Pavir.J27732.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J36821.1.ppacid=30288084 transcript=Pavir.J36821.1 locus=Pavir.J36821 ID=Pavir.J36821.1.v1.1 annot-version=v1.1
select all | unselect

A list of species letter codes included in the protein names can be found here (opens in new tab).

↑ back to top


¹ Information recieved using NCBI E-utilities and NCBI taxonomy database.
Impressum